O Incidente Isshi (乙巳の変, Isshi no Hen) leva o nome do nome zodiológico do ano 645 durante o qual ocorreu a Reforma Taika, um evento transformador na história imperial japonesa.

O incidente foi uma trama bem-sucedida de Nakatomi no Kamatari, Príncipe Naka no Ōe e outros que conspiraram para eliminar o principal ramo do clã Soga, começando com o assassinato de Soga no Iruka. O assassinato de Iruka ocorreu em 10 de julho de 645 ( data tradicional japonesa: 12º dia do 6º mês de 645), durante uma cerimônia de corte em que os memoriais dos Três Reinos da Coréia estavam sendo lidos para a Imperatriz Kōgyoku por Ishikawa no Maro. O príncipe Naka no Ōe fez preparativos elaborados, incluindo fechar os portões do palácio, subornar vários guardas do palácio, esconder uma lança no salão onde a cerimônia aconteceria e ordenar que quatro homens armados atacassem Iruka. No entanto, quando ficou claro que os quatro homens estavam com muito medo de cumprir as ordens, Naka no Ōe correu para o próprio Iruka e cortou sua cabeça e ombro. Iruka não foi morto imediatamente, mas protestou sua inocência e implorou por uma investigação. O príncipe Naka no Ōe defendeu seu caso perante a Imperatriz Kōgyoku, e quando ela se retirou para considerar o assunto, os quatro guardas finalmente correram para Iruka novamente e completaram o assassinato. Pouco depois, o pai de Iruka, Soga no Emishi, se matou incendiando sua residência. A conflagração destruiu a cópia manuscrita do Tennōki e muitos outros tesouros imperiais que foram levados para a guarda do Soga, mas Fune no Fubitoesaka rapidamente agarrou o Kokki em chamas. Mais tarde, ele disse ter apresentado a Naka no Ōe; mas nenhuma cópia existente conhecida do trabalho permanece. A violência realmente se desenrolou na presença de Kōgyoku. A Imperatriz respondeu a esse choque decidindo renunciar ao trono. A sociedade japonesa durante o período Asuka era sensível a questões de "poluição", tanto espiritual quanto pessoal. As mortes - especialmente um assassinato violento em proximidade física com a Imperatriz - foram consideradas entre os piores atos de poluição possíveis - um evento tão impressionante que teria garantido dias de reclusão em um processo incerto tentando reparar o que teria sido interpretada como uma espécie de palavrão.

Embora Kōgyoku quisesse abdicar imediatamente em favor de Naka no Ōe, a conselho de Nakatomi no Kamatari ele insistiu que o trono deveria passar para seu irmão mais velho, Furuhito no Ōe, ou para seu tio materno (irmão de Kōgyoku) o príncipe Karu. Furuhito no Ōe resolveu o impasse declarando sua intenção de renunciar a qualquer reivindicação ao trono, tomando a tonsura de um monge budista. Naquele mesmo dia – tradicionalmente dito ser 12 de julho de 645, Furuhito no Ōe raspou o cabelo em Hōkō-ji, ao ar livre entre o Salão do Buda e o pagode. Neste ponto, Kōgyoku abdicou em favor de seu irmão, que logo depois ascendeu ao trono como Imperador Kōtoku (645-654). Após a morte de Kōtoku, Kōgyoku assumiu o trono mais uma vez como Saimei (r. 655–661), antes que o próprio Naka no Ōe finalmente assumisse o trono como Imperador Tenji (661–672).