O Cerco de Jerusalém (cerca de 589.587 AEC) foi o evento final das revoltas judaítas contra a Babilônia, nas quais Nabucodonosor II, rei do Império Neobabilônico, sitiou Jerusalém, a capital do Reino de Judá. Jerusalém caiu após um cerco de 30 meses, após o qual os babilônios devastaram a cidade e destruíram o Primeiro Templo. O Reino de Judá foi dissolvido e muitos de seus habitantes foram exilados para a Babilônia.

Durante o final do século VII aC, Judá tornou-se um reino vassalo da Babilônia. Em 601 AEC, Jeoiaquim, rei de Judá, revoltou-se contra o domínio babilônico. apesar dos fortes protestos do profeta Jeremias. Jeoaquim morreu por razões pouco claras e foi sucedido por seu filho, Jeconias. Em 597 AEC, os babilônios cercaram Jerusalém e a cidade se rendeu. Nabucodonosor saqueou Jerusalém e deportou Jeconias e outros cidadãos proeminentes para a Babilônia; O tio de Jeconias, Zedequias, foi empossado rei. Mais tarde, encorajado pelos egípcios, Zedequias lançou uma segunda revolta, e um exército babilônico foi enviado para retomar Jerusalém. abaixo da cidade. Zedequias tentou escapar, mas foi capturado perto de Jericó. Em Riblah foi forçado a assistir à morte de seus filhos e, posteriormente, seus olhos foram arrancados. A destruição de Jerusalém e seu templo levou a uma crise religiosa, espiritual e política, que deixou sua marca na literatura profética e na tradição bíblica. O Reino de Judá foi abolido e anexado como uma província babilônica com seu centro em Mispá. A elite da Judéia, incluindo a dinastia davídica, foi exilada para a Babilônia. Depois que Babilônia caiu diante de Ciro, o Grande, fundador do Império Aquemênida Persa, em 539 AEC, ele permitiu que os exilados da Judéia retornassem a Sião e reconstruíssem Jerusalém. O Segundo Templo foi concluído em 516 aC.

O Império Neobabilônico, também conhecido como Segundo Império Babilônico e historicamente conhecido como Império Caldeu, foi o último dos impérios da Mesopotâmia a ser governado por monarcas nativos da Mesopotâmia. Começando com a coroação de Nabopolassar como rei da Babilônia em 626 aC e sendo firmemente estabelecido através da queda do Império Neo-Assírio em 612 aC, o Império Neobabilônico e sua dinastia caldeia governante foram de curta duração, conquistados após menos de um século por o Império Aquemênida Persa em 539 aC.

A derrota dos assírios e a transferência do império para a Babilônia marcaram a primeira vez que a cidade, e o sul da Mesopotâmia em geral, subiram para dominar o Antigo Oriente Próximo desde o colapso do Antigo Império Babilônico de Hamurabi quase mil anos antes. O período do domínio neobabilônico, portanto, viu um crescimento econômico e populacional sem precedentes em toda a Babilônia e um renascimento da cultura e das obras de arte, com os reis neobabilônicos realizando grandes projetos de construção, especialmente na própria Babilônia, e trazendo de volta muitos elementos dos 2.000 anteriores ou então anos de cultura sumério-acadiana.

O império mantém uma posição dentro da memória cultural moderna principalmente devido ao retrato pouco lisonjeiro da Babilônia e seu maior rei, Nabucodonosor II, na Bíblia, que se deve à destruição de Jerusalém por Nabucodonosor em 587 aC e ao subsequente cativeiro babilônico. Fontes babilônicas descrevem o reinado de Nabucodonosor como uma idade de ouro que transformou a Babilônia no maior império de seu tempo.

As políticas religiosas introduzidas pelo rei final do Império Neobabilônico, Nabonidus, que favoreceu o deus da lua Sîn sobre a divindade patronal da Babilônia, Marduk, eventualmente forneceram um casus belli que permitiu ao rei aquemênida Ciro, o Grande, invadir a Babilônia em 539 aC, retratando-se como um campeão de Marduk restaurando divinamente a ordem na região. Babilônia permaneceu culturalmente distinta por séculos, com referências a pessoas com nomes babilônicos e referências à religião babilônica conhecida desde o período parta no século I aC. Embora a Babilônia tenha se revoltado várias vezes durante o governo de impérios posteriores, nunca conseguiu restaurar sua independência.