Juan Fernández (c. 1536 - c. 1604) foi um explorador e navegador espanhol nas regiões do Pacífico do Vice-Reino do Peru e Capitania Geral do Chile, a oeste da América do Sul colonial. Ele é mais conhecido pela descoberta de uma rota marítima rápida de Callao (Peru) a Valparaíso (Chile), bem como pela descoberta das Ilhas Juan Fernández na costa do Chile.