Shenzhou 1 ( chinois simplifié :神舟一号; chinois traditionnel :神舟一號; pinyin : Shenzhōu Yīhào ) lancé le 19 novembre 1999, était le premier lancement sans équipage du vaisseau spatial Shenzhou. Le vaisseau spatial utilisé n'était pas équipé d'un système de survie ou d'un système d'évacuation d'urgence. Après avoir fait 14 orbites autour de la Terre, la commande de rétro-feu a été envoyée par le navire de suivi Yuan Wang 3 au large des côtes de la Namibie à 18h49 UTC. Après une rentrée réussie, il a atterri à environ 415 kilomètres (258 mi) à l'est de sa rampe de lancement et à 110 kilomètres (68 mi) au nord-ouest de Wuhai, en Mongolie intérieure.

Le premier vaisseau spatial de Shenzhou était différent de ceux utilisés plus tard. Au lieu de comporter des panneaux solaires dépliables, Shenzhou 1 était équipé de cellules solaires fixes. Au cours de ce premier vol, il n'y a pas eu non plus de changements d'orbite. Selon Qi Faren, le concepteur en chef du vaisseau spatial, seuls 8 des 13 sous-systèmes à bord du vaisseau spatial étaient opérationnels. Shenzhou 1 a été conçu principalement pour tester la fusée Longue Marche 2F. Les seuls systèmes et capacités testés sur le vaisseau spatial étaient la séparation des modules, le contrôle d'attitude, la rentrée du corps de levage, le bouclier thermique et la récupération au sol.

On pense que le vaisseau spatial a transporté 100 kilogrammes (220 lb) de graines pour étudier les effets sur eux de l'environnement spatial. On pense également que l'avant du module Orbital était équipé d'un boîtier ELINT factice, à partir de Shenzhou 2 équipé de modèles entièrement fonctionnels.

Il a été annoncé en juin 1999 que le vol aurait lieu en octobre de la même année. À peu près au même moment, des images ont été publiées sur un forum Internet militaire chinois du lanceur Longue Marche 2F et du bâtiment d'assemblage de véhicules qui seraient utilisés. Après une explosion de propulseur signalée au centre de lancement de satellites de Jiuquan (bien que l'explosion ait été démentie par les autorités chinoises), le lancement a été repoussé.